Die Amadeu Antonio Stiftung arbeitet im Kooperationsverbund gegen Rechtsextremismus als koordninierende Organisation. Der Kooperationsverbund tritt unter dem Namen "KompRex – Kompetent in der Rechtsextremismusprävention" auf. In ihm arbeiten zudem fünf weitere Organisationen:
- cultures interactive e. V.
- Gesicht Zeigen! Für ein weltoffenes Deutschland e. V.
- Jugendbildungsstätte Bremen LidiceHaus gGmbH
- Aktion Sühnezeichen Friedensdienste e. V.
- Bund der Alevitischen Jugendlichen in Deutschland e. V. (BDAJ)
Eine Übersicht der geförderten Kooperationsverbünde bietet die Seite "Kooperationsverbünde und Themen".