Die Amadeu Antonio Stiftung arbeitet im Kooperationsverbund gegen Rechtsextremismus unter dem Projekttitel "KompRex – Kompetent in der Rechtsextremismusprävention" als koordinierende Organisation. Im Kooperationsverbund arbeiten zudem fünf weitere Organisationen:
- cultures interactive e. V.
- Gesicht Zeigen! Für ein weltoffenes Deutschland e. V.
- Jugendbildungsstätte Bremen LidiceHaus gGmbH
- Bundesarbeitsgemeinschaft Kirche und Rechtsextremismus (in Trägerschaft von ASF e. V.)
- Bund der Alevitischen Jugendlichen in Deutschland e. V.
Eine Übersicht der geförderten Kooperationsverbünde bietet die Seite "Kooperationsverbünde und Themen".